En 1996, Bajsa Arifovska entre à l'Académie de musique de Skopje, où elle rencontre le professeur Dragan Dautovski. Il lui enseigne les instruments traditionnels macédoniens tels que le kaval, le gajda, le tambura et le tapan. Elle a commencé sa carrière musicale professionnelle en effectuant des tournées en Macédoine, en Europe et en Australie.

Bajsa est membre de l'orchestre de l'Ensemble national de danses et de chants folkloriques Tanec à Skopje. Elle a enregistré plusieurs albums et en 2013, elle sort le CD « Calgija de Bajsa », en collaboration avec des maîtres musiciens calgija de Skopje.